Бако Саакян родился 30 августа 1960 года в Степанакерте.

В 1977 году окончил среднюю школу №1 г. Степанакерта.

В 1978-80 гг. служил в Советской Армии.

В 1981 году был принят на работу в Степанакертский производственно-механизированный комбинат номер 9 в качестве слесаря-механика. Работал на Степанакертском комбинате стройматериалов в качестве рабочего по раздроблению камня.

В 1983-1987 гг. работал мастером-реставратором в Степанакертском филиале научного управления по восстановлению старинных памятников.

В 1987-1990гг. - сотрудник областного управления снабжения.

С 1988 года - один из активистов Арцахского Движения.

В 1990 году вступил в ряды сил самообороны Нагорного Карабаха.

В 1992-1993 гг. ─ заместитель начальника комитета сил самообороны НКР.

В 1993-1995 гг. ─ начальник штаба по тылу Армии обороны НКР.

В 1995-1996 гг. ─ заместитель командующего АО НКР по внешним связям.

В 1996-1997 гг. ─ заместитель командира 10-й горнострелковой дивизии АО НКР.

В 1997-1999 гг. ─ помощник министра внутренних дел и нацбезопасности Республики Армения.

В 1999-2001 г. ─ министр внутренних дел НКР.

С 2001 -2007 гг. ─ начальник госуправления нацбезопасности Нагорно-Карабахской Республики, директор службы нацбезопасности НКР. Воинское звание - генерал-майор.

Президент Нагорно-Карабахской Республики с 7 сентября 2007г.

Награжден орденом НКР «Боевой крест» 1-й степени (НКР),  орденом Российской Федерации «Петр Великий» 1-й степени, медалями «За заслуги перед Отечеством» 1-й степени и «Вазген Саркисян» (Республика Армения), а также другими наградами.

Действительный член Академии РФ по вопросам безопасности, обороны и законности.

Окончил юридический факультет Арцахского государственного университета.

Женат, имеет двоих детей.